日本是一个地震频繁，台风多发，火山活跃的国家，因此自然灾害在日本是家常便饭，只不过严重程度与频率不同罢了。然而，日本也有一些城市相对于其他城市来说自然灾害发生的频率比较低，那么哪些城市是日本自然灾害最少的呢？
首先，大阪、京都、福冈和冲绳等城市相对于其他城市而言自然灾害发生几率比较低。福冈市位于北九州市北部，受到周边山脉的保护，不容易受到台风等影响。京都和大阪这两座城市在日本本州岛内陆位置较为靠西，不容易受到东部太平洋上的台风影响。冲绳则地处亚热带，当台风来袭时能够有效缓冲风暴的袭击。
其次，城市基础设施建设和整体抗灾能力也是影响自然灾害频率的重要因素。例如，东京因为市区建设在平原上，长期以来加强了基础设施的建设和抗灾准备，灾害发生的频率自然就相对较低。与此相反，小笠原群岛虽然距离东京不远，但由于地理位置较为偏远，基础设施和抗灾准备薄弱，因而经常受到台风和地震的影响。
再者，一些城市位于海拔相对较高的地区，也更容易避免洪水等自然灾害。日本的高知县是峡谷、山林、湖泊等自然景观组成的地区，大部分地区都位于海拔较高的山区，因此很少受到大型自然灾害的影响。
最后，政府的灾害防治工作也会对城市自然灾害发生频率产生影响。日本政府重视自然灾害防治，会定期组织演习和进行基础设施建设，提高城市的抗灾能力。这样的例子有日本熊本县的防灾设施设备建设，以及东京都的地下排水设施建设等。
综上所述，多个因素综合影响了城市自然灾害发生频率。福冈、京都、大阪和冲绳等城市由于受到地理位置和气候等因素的影响，相对比较少受到自然灾害的影响。而其他城市则因为基础设施建设和抗灾能力等方面的原因，自然灾害的频率更高。
